Vào thời điểm trên, chiếc xe container mang BKS 89C - 014.33 do tài xế Dương Sơn Kho (SN 1974), trú ở tỉnh Hưng Yên điều khiển kéo theo rơ-moóc BKS 51R - 5266 lưu thông trên Quốc lộ 1A theo hướng Hà Nội - Vinh bất ngờ đâm qua hàng rào sắt rồi đổ nghiêng lên đường ray tại Km 266 thuộc địa bàn xã Quỳnh Giang, huyện Quỳnh Lưu (Nghệ An).
Đúng lúc đó tàu thống nhất mang số hiệu SE3 hành trình Hà Nội - TP Hồ Chí Minh vừa tới. Lái tàu đã phát hiện kịp thời nên đã dừng khẩn cấp đoàn tàu để bảo vệ cho hàng trăm hành khách trên tàu. Tuy nhiên, do khoảng cách phát hiện gần và cả chiếc ôtô nằm sát với thanh ray nên đầu máy tàu bị hư hỏng, đoàn tàu không thể tiếp tục chạy.
Ngay sau khi nhận được tin báo, lực lượng ngành đường sắt và CA huyện Quỳnh Lưu đã kịp thời có mặt tổ chức giải cứu chiếc ô tô ra khỏi hiện trường và điều tiết giao thông.
Vụ tai nạn đã làm lái xe container bị thương nhẹ, một loạt tàu thống nhất Bắc Nam mang số hiệu SE3, SE20, NA1 và nhiều tàu hàng bị chậm lại do phải chờ đường cẩu ô tô ra khỏi đường sắt. Đến 7h cùng ngày, đường sắt thống nhất qua vị trí tai nạn mới được lưu thông trở lại.
Hiện trường vụ tai nạn